Das Anatomische Museum Basel steht im Dienste der Wissensvermittlung, der Anschauung und der Bewahrung einer weltweit einmaligen Sammlung von historischen Präparaten. Das Anatomische Museum ist Bestandteil der Medizinischen Fakultät.

Es werden vor allem Originalpräparate von menschlichen Körperbereichen, Organen und Geweben ausgestellt, die systematisch und topographisch geordnet sind und den Aufbau des Körpers darstellen. Ferner wird die vorgeburtliche Entwicklung des Menschen gezeigt. Sonderausstellungen erläutern in verständlicher Form besondere Gebiete der Anatomie und deren verwandten Wissenschaften.